自建房的产权过户问题主要与土地性质紧密关联。若自建房是建立在集体用地上，这类房屋属于小产权房，法律上是不允许进行买卖的，因此也没办法办理过户及房产证。这在某种程度上预示着，购买集体用地上自建房的买家将面临无法合法拥有该房产的风险，有几率会使经济损失。
相对而言，若自建房是建立在国有土地上，则该房屋是能够直接进行交易的，买卖双方可以合法办理过户手续，并申请房产证。在进行自建房交易时，买家需仔细核实房屋的土地性质，以避免因购买小产权房而引发的法律纠纷。
农村自建房的房产证办理流程相对复杂，涉及多个环节。根据《房屋登记办法》第82条的规定，农村自建房的房产证申请需要经过以下步骤：首先，建房户需向村委会提出建房申请，村委会审核后同意并签字盖章。接着，建房户需向乡建办提出申请，乡建办工作人员会进行实地踏看，确认建房的合规性。
在获得乡建办的同意后，建房户需领取房屋建设申请表，并经过乡建办的签字同意。随后，乡主管领导也需签字盖章以核实同意，最后，建房户需将申请材料提交至县规划建设局进行审批。经过以上步骤后，建房户便可以领取产权证，完成房产证的办理。
在申请农村自建房房产证时，建房户要准备一系列材料，以确保申请的顺利进行。首先，需提交登记申请书以及申请人的身份证明。其次，需提供宅基地使用权证明或集体所有建设用地使用权证明。此外，申请登记房屋符合城乡规划的证明、房屋测绘报告或村民住房平面图也是必不可少的材料。
如果申请人是房屋所在地农村集体经济组织的成员，还需提交相关证明材料。对于农村集体经济组织申请房屋所有权初始登记的情况，还需提供经村民会议同意或由村民会议授权的证明材料。办理房屋登记机构在受理申请后，会将申请登记事项在房屋所在地农村集体经济组织内进行公告，公告无异议或异议不成立的，方可予以登记。
在进行自建房产权过户时，购房者需要非常注意土地性质的确认，以避免因购买小产权房而导致的法律风险。同时，在办理房产证的过程中，务必准备齐全所需要的材料，确保申请流程的顺利进行。建议购房者在交易前咨询专业技术人员或法律顾问，以获取更为准确的信息和指导，确保自身权益得到保障。
